Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim30bE9PVL6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim30bE9PVL6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms