Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms