Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cngb1E1AZ71 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cngb1E1AZ71 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms