Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1110002E22RikE0CYV9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms