Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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