Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tgfbr3lD3YZZ2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tgfbr3lD3YZZ2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tgfbr3lD3YZZ2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tgfbr3lD3YZZ2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tgfbr3lD3YZZ2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms