Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms