Protein–RNA interactions for Protein: D3YZI9

Pgbd5, PiggyBac transposable element-derived protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd5D3YZI9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms