Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc170D3YXL0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms