Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn24D3YXJ9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn24D3YXJ9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn24D3YXJ9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn24D3YXJ9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn24D3YXJ9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn24D3YXJ9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms