Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam47eD3YWC7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms