Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm4950D3YUM8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms