Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip3B9EHT4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms