Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms