Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms