Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms