Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms