Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5483B2RV77 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms