Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usf3B2RUQ2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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