Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apba1B2RUJ5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms