Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PtprbB2RU80 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PtprbB2RU80 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PtprbB2RU80 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PtprbB2RU80 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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PtprbB2RU80 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PtprbB2RU80 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PtprbB2RU80 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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PtprbB2RU80 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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PtprbB2RU80 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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