Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zbed5B2RPU8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zbed5B2RPU8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zbed5B2RPU8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Zbed5B2RPU8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Zbed5B2RPU8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Zbed5B2RPU8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Zbed5B2RPU8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zbed5B2RPU8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed5B2RPU8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms