Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Uhrf1bp1B2KF50 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uhrf1bp1B2KF50 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uhrf1bp1B2KF50 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uhrf1bp1B2KF50 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Uhrf1bp1B2KF50 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.3 ms