Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms