Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b1B1AZQ8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms