Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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