Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skint8A7XV07 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms