Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930435E12RikA6X8Z9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms