Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbp4A4UUI3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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