Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf2A3KGV1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms