Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms