Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CatsperbA2RTF1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatsperbA2RTF1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 419.3 ms