Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col9a3A2ACT7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms