Protein–RNA interactions for Protein: A2A9C3

Szt2, KICSTOR complex protein SZT2, mousemouse

Predictions only

Length 3,431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szt2A2A9C3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Szt2A2A9C3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Szt2A2A9C3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms