Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms