Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprfA2A8L5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprfA2A8L5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms