Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkd2l1A2A259 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms