Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

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Length 1,177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nlrp1bA1Z198 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nlrp1bA1Z198 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nlrp1bA1Z198 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms