Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc173A0JLY1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms