Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A0A0U1RNP2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms