Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrit3W8DXL4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit3W8DXL4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms