Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt27Q9Z320 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms