Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Homer1Q9Z2Y3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms