Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hdac6Q9Z2V5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hdac6Q9Z2V5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hdac6Q9Z2V5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hdac6Q9Z2V5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hdac6Q9Z2V5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hdac6Q9Z2V5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hdac6Q9Z2V5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Hdac6Q9Z2V5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hdac6Q9Z2V5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Hdac6Q9Z2V5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hdac6Q9Z2V5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hdac6Q9Z2V5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Hdac6Q9Z2V5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Hdac6Q9Z2V5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hdac6Q9Z2V5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hdac6Q9Z2V5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Hdac6Q9Z2V5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Hdac6Q9Z2V5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Hdac6Q9Z2V5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Hdac6Q9Z2V5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Hdac6Q9Z2V5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Hdac6Q9Z2V5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hdac6Q9Z2V5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hdac6Q9Z2V5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hdac6Q9Z2V5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hdac6Q9Z2V5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hdac6Q9Z2V5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hdac6Q9Z2V5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hdac6Q9Z2V5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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