Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms