Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J0

Slc23a1, Solute carrier family 23 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc23a1Q9Z2J0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc23a1Q9Z2J0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms