Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I9

Sucla2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sucla2Q9Z2I9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sucla2Q9Z2I9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sucla2Q9Z2I9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms