Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Robo3Q9Z2I4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Robo3Q9Z2I4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Robo3Q9Z2I4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Robo3Q9Z2I4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Robo3Q9Z2I4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Robo3Q9Z2I4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Robo3Q9Z2I4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms