Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms