Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms